海棠茎腐病病菌不发生胞子，以菌丝侵人传布。菌丝早期无色，后期淡褐色。腐素性较强。习居泥土或病残组织内越冬。气温适宜(20-24度)湿度较大，有利于病菌发展养殖。
海棠分株或扦插养殖时造成伤口，或在阴雨气候，浇水过量，土壤积水时易被病菌损害，引发病害严重发生，植株腐臭灭亡。受害植株在接近土面的茎基部初生暗色黑点，扩大后呈棕褐色，缩短腐臭。病菌侵染叶片引发暗绿色水渍状圆斑；侵染叶柄则呈褐色腐臭。湿润时在病斑处可见白色丝状物，严沉痾株倒状。
防治方式以下：选用有机质丰硕的新土或经晒干后颜色较深、质地坚实、碎泥时泥粉较少的塘泥及河泥作栽培土。最好不消旧盆土。施用的基肥要充实腐熟；增强田间经管。空气湿度大时少浇或不浇水，以连结盆中土壤潮湿为度。少施氮肥，多施磷、钾肥，实时摘除下部接触泥土的病叶、老叶并销毁。